A cronologia de sua vida é dificultada pela falta de registro. Seu nome aparece em documentos da Confraria de Nossa Senhora, de sua cidade natal, para a qual executa trabalhos de 1486 até o ano de sua morte. Das 35 a 40 telas atribuídas a Bosch, apenas sete são assinadas e nenhuma é datada.
Entre seus primeiros trabalhos estão Os Sete Pecados Capitais e Ecce Hommo. Em suas telas, vêem-se multidões e figuras estranhas, quase animalescas. Duas delas são particularmente representativas de sua obra.
A primeira, A Tentação de Santo Antônio, mostra uma composição mais fluida que a dos primeiros quadros. A segunda, O Jardim das Delícias, é considerada seu trabalho mais maduro e descreve a criação da mulher. O pintor é apreciado por seus contemporâneos e exerce, séculos depois, influência sobre os surrealistas.